医院的污水性质特殊，来源及成分复杂，并且含有一些特殊的污染物，如药物、消毒剂、诊断用剂、洗涤剂以及大量的病原性微生物。其水质与生活污水相似，但需强化后期深度处理及消毒单元，常规采用格栅拦截废水中大块杂物，然后生化去除废水中的有机污染物，最终通过高效过滤器、活性炭过滤器等深度处理手段确保出水达标，最终出水需经消毒装置消毒后方可排放或回用。